Av protein struktur prinsipper: November 2011




Forskning i biologi ved Birkbeck, og andre relaterte tjenester til den nærliggende University College London, er kombinert i Institutt for konstruksjons Molecular Biology. Instituttet besitter en vanlig seminarprogram - hver onsdag under lunsj termtime - som kaller på utestående forskere, mange med linker til universiteter, for å presentere sin forskning. For noen uker siden, rapportøren seminaret var et elektron Mikroskopist, Sarah Butcher, som er basert ved Universitetet i Helsinki, Finland. Hans gruppe har studert strukturen av et virus som forårsaker en kjent sykdom: meslinger.

Meslinger har vært kjent i årtusener. Sykdommen (selv om det selvsagt ikke er årsaken) er blitt beskrevet i det gamle Egypt. Det er en av de mest kjente smittsomme virus, men de menneskene de møter meslinger (hvis i det hele tatt) som en lidelse ubehagelig barndommen er ofte overrasket over å høre at det er en morder. Rundt 164 000 mennesker mistet livet som følge av meslinger infeksjon i 2008, de fleste av vedvarende immunsuppresjon, snarere enn akutt infeksjon. De fleste dødsfallene skjer i Afrika og Sør-Asia; en mindre epidemier har nylig dukket opp i Storbritannia, når MMR vaksine tapt popularitet over MMR autisme skremme.

Meslinger viruset er et paramyxovirus; en kappevirus med en enkel streng av RNA som sitt genom, og nær beslektet med virus som forårsaker kusma, respiratorisk syncytialt virus infeksjon (RSV) og para-influensa hos spedbarn og barn. Den har to overflateproteiner og IIS tenkt å direkte koble membraner av infiserte celler med en av disse.

Inntil nylig har strukturstudier av meslingvirus er ganske begrenset. Mange grupper har undersøkt ved hjelp av en negativ farging elektronmikroskopi teknikk kalt, men som bare kan se på overflaten av viruset. ' Strukturer av et intakt protein av meslingvirus og de andre tre domener ble deponert i Protein Data Bank; hemagglutinin (f.eks PDB 2RKC code); to separate domener av fosfoprotein (1OKS og 2K9D) og en struktur av fragmenter av to proteiner bare kalt P og N er bundet sammen (1T60).

Sarah Butcher og hans team brukte en teknikk som kalles Cryo-elektronmikroskopi, som gjør det indre av virus som skal vises, for å studere meslinger viruset. Deres funn førte dem til å fokusere på protein matrisen, som antas å være viktig for representasjon av viruset (cyan farget protein i bildene nedenfor). Alle tidligere modeller måtte plassere matrisen protein som dekker den indre del av den virale membran. Hva gruppen Butcher så, var imidlertid helt annerledes. De kunne se deler av nukleokapsid protein som omgir - det virale RNA og dets beskyttende protein forbundet - og videre analyse identifiserte det som proteingrunnmasse. Den strengt til deler av nukleokapsidet legeringsmatrisen for å oppnå stav-lignende strukturer, og disse bøy i anti-parallelle enheter som er litt remniscent antiparallelle beta-ark i proteiner. Dette mønsteret tyder på at viruset replikering prosessen vil være mer komplisert og gjort flere potensielle narkotika mål enn tidligere antatt.
to modeller for organisering av proteiner og RNA av meslingvirus. Topp: den gamle modellen, og matrisen protein (cyan) som omgir virus strøk. Bunn: slakteren gruppemodellen, med matrisen protein som omgir deler av nukleokapsidet. Credit Figur:. Proc Nat. Acad. Sci. USA (2011)


Strukturer av proteiner fra andre virus, spesielt HIV og influensa, vil bli dekket ganske mye senere i PPS. oss ikke studere den teknikk som brukes i denne undersøkelsen mikroskopi, Cryo-elektron, PPS men en del av ett av alternativene for andre år kurs PPS, teknikker Structural Molekylærbiolog



Legg igjen en kommentar